Comparatif Complet des Logiciels de Facturation Suisses en 2025

Vous cherchez le meilleur logiciel de facturation pour votre entreprise suisse ? Découvrez notre comparaison détaillée de ToBill, Bexio, Magic Heidi, MILKEE, Smallinvoice et SWISS21. Prix, fonctionnalités, avantages : tout ce qu'il faut savoir pour faire le bon choix.

Pourquoi comparer les logiciels de facturation suisses ?

Le marché suisse de la facturation est hautement fragmenté avec plus d'une dizaine d'acteurs qui se disputent votre attention. Entre les leaders historiques comme Bexio, les nouveaux entrants modernes comme Magic Heidi ou ToBill, et les solutions gratuites comme SWISS21, il n'est pas facile de s'y retrouver.

Ce guide complet vous aide à comparer objectivement les principales solutions disponibles sur le marché suisse en 2025, en tenant compte de critères essentiels :

  • Prix et modèles tarifaires (mensuel, annuel, gratuit)
  • Fonctionnalités principales (QR-facture, multi-devises, rappels automatiques)
  • Spécificités suisses (conformité TVA, report fiduciaire, TWINT)
  • Expérience utilisateur (simplicité, design, courbe d'apprentissage)
  • Support et accompagnement (français, allemand, italien)
  • Public cible (freelances, PME, fiduciaires)

💡 Notre recommandation pour 2025

ToBill se démarque par son rapport qualité-prix imbattable (25 CHF/mois), son interface moderne et intuitive, et ses fonctionnalités pensées pour les indépendants et PME suisses : QR-facture native, IA pour scanner les dépenses, report automatique vers les fiduciaires.

Comparaison des fonctionnalités et tarifs

Choisissez la solution qui correspond le mieux à vos besoins

ToBill

25 CHF
Plan gratuit✅ (limité)
Essai gratuit10 jours
QR-Facture suisse
IA scan dépenses
Report fiduciaire auto
Interface moderne⭐⭐⭐⭐⭐
Essayer gratuitement

Bexio

45+ CHF
Plan gratuit
Essai gratuit30 jours
QR-Facture suisse
IA scan dépenses⚠️
Report fiduciaire auto
Interface moderne⭐⭐⭐

Magic Heidi

30 CHF
Plan gratuit✅ (3 factures)
Essai gratuit-
QR-Facture suisse
IA scan dépenses
Report fiduciaire auto⚠️
Interface moderne⭐⭐⭐⭐⭐

MILKEE

30 CHF
Plan gratuit
Essai gratuit7 jours
QR-Facture suisse
IA scan dépenses
Report fiduciaire auto
Interface moderne⭐⭐⭐⭐

Smallinvoice

30+ CHF
Plan gratuit✅ (limité)
Essai gratuit-
QR-Facture suisse
IA scan dépenses
Report fiduciaire auto
Interface moderne⭐⭐

SWISS21

7 CHF
Plan gratuit✅ (complet)
Essai gratuit-
QR-Facture suisse
IA scan dépenses
Report fiduciaire auto
Interface moderne⭐⭐⭐

Comparaisons détaillées

ToBill vs Bexio : Le challenger face au leader

Bexio est le leader incontesté du marché suisse avec plus de 10 ans d'existence et des centaines d'entreprises clientes. Racheté par une grande entreprise il y a quelques années, Bexio propose une solution tout-en-un qui va bien au-delà de la facturation : gestion de projets, paie, CRM, etc.

ToBill, en revanche, se positionne comme une alternative moderne, simple et abordable pour les indépendants et PME qui n'ont pas besoin de toutes les fonctionnalités d'un ERP complet.

💰 Avantage prix : ToBill

ToBill démarre à 25 CHF/mois (plan Pro) contre 45+ CHF/mois/utilisateur pour Bexio. Pour une équipe de 3 personnes, cela représente une économie de 1'560 CHF/an.

Points forts de ToBill :

  • Interface moderne et épurée (vs interface datée de Bexio)
  • Onboarding en 5 minutes (vs plusieurs heures pour configurer Bexio)
  • IA native pour scanner les dépenses (Bexio n'a pas cette fonctionnalité)
  • Prix transparent et compétitif
  • Focus sur la facturation (moins de fonctionnalités = moins de complexité)

Points forts de Bexio :

  • Écosystème complet (gestion de projets, paie, stock, CRM)
  • Nombreuses intégrations tierces (E-Banking, PostFinance)
  • Support multilingue étendu et nombreux partenaires fiduciaires
  • Application mobile mature (iOS et Android)

🎯 Notre verdict : Choisissez ToBill si vous cherchez une solution simple, moderne et abordable pour la facturation. Choisissez Bexio si vous avez besoin d'un ERP complet avec gestion de projets, paie et CRM.

ToBill vs Magic Heidi : Le match des modernes

Magic Heidi est un concurrent direct de ToBill : lancé en 2022, avec une interface moderne, mobile-first, et une approche axée sur l'expérience utilisateur. Magic Heidi propose des applications natives sur iPhone, Mac, Web et Android, ce qui en fait l'outil disponible sur le plus de plateformes.

Les deux solutions partagent une philosophie similaire : simplicité, design moderne, et focus sur les freelances et PME suisses.

🎨 Design et UX : Match nul

ToBill et Magic Heidi proposent tous deux une interface moderne et intuitive. Le choix se fera sur d'autres critères.

Avantages de ToBill :

  • Prix inférieur : 25 CHF/mois vs 30 CHF/mois
  • Report automatique vers fiduciaires (Magic Heidi a des limitations)
  • Essai gratuit de 10 jours (Magic Heidi limite à 3 factures)
  • Support prioritaire dès le plan Pro

Avantages de Magic Heidi :

  • Applications mobiles natives déjà disponibles (iOS, Android, Mac)
  • Synchronisation bancaire (Import des relevés)
  • Plus axé "lifestyle freelance" (intégrations avec outils modernes)
  • Avis Google Maps 5/5 étoiles

🎯 Notre verdict : Choisissez ToBill si vous travaillez avec une fiduciaire et cherchez le meilleur rapport qualité-prix. Choisissez Magic Heidi si vous privilégiez les applications mobiles natives et la synchronisation bancaire.

ToBill vs MILKEE : Focus sur les freelances

MILKEE est développé par Nicolas, un solo-entrepreneur de la région de Zurich. MILKEE se spécialise pour les freelances suisses-allemands et dispose d'excellents avis clients (5/5 étoiles sur Google Maps).

Limitation majeure : MILKEE est uniquement disponible en allemand, ce qui limite son adoption en Suisse romande et au Tessin.

🌍 Avantage multilingue : ToBill

ToBill est disponible en français, allemand et anglais, ce qui le rend accessible à tous les cantons suisses. MILKEE est limité au marché germanophone.

Avantages de ToBill :

  • Support multilingue (FR, DE, EN)
  • Report automatique vers fiduciaires (MILKEE ne propose pas cette fonctionnalité)
  • IA pour scanner les dépenses (absent chez MILKEE)
  • Prix identique (25-30 CHF/mois)

Avantages de MILKEE :

  • Excellente réputation dans la communauté germanophone suisse
  • Support personnalisé par le fondateur (entrepreneur solo)
  • Interface très simple et épurée

🎯 Notre verdict : Choisissez ToBill si vous êtes en Suisse romande ou si vous travaillez avec une fiduciaire. Choisissez MILKEE si vous êtes un freelance germanophone cherchant une solution ultra-simple.

ToBill vs Smallinvoice : Ancien vs Moderne

Smallinvoice existe depuis plus de 10 ans et a remporté le Swiss Fintech Award en 2017. Cependant, l'interface utilisateur n'a pas évolué et semble datée et complexe comparée aux standards modernes.

⚡ Avantage expérience utilisateur : ToBill

ToBill propose une interface moderne conçue en 2024, avec un onboarding guidé et une courbe d'apprentissage minimale. Smallinvoice nécessite plusieurs heures d'apprentissage.

Avantages de ToBill :

  • Interface moderne et intuitive (vs interface complexe et datée)
  • Prix plus clair et transparent
  • IA pour scanner les dépenses (absent chez Smallinvoice)
  • Onboarding rapide en 5 minutes

Avantages de Smallinvoice :

  • Fonctionnalités étendues (gestion de stock, time tracking)
  • Nombreuses intégrations bancaires
  • Historique et stabilité (10+ ans)

🎯 Notre verdict : Choisissez ToBill si vous cherchez une solution moderne et simple. Choisissez Smallinvoice si vous avez besoin de fonctionnalités avancées comme le time tracking ou la gestion de stock.

ToBill vs SWISS21 : Payant vs Gratuit

SWISS21 est un projet financé par quelques grandes entreprises suisses qui propose un plan entièrement gratuit (financé par des offres de tiers). C'est le seul acteur du marché à proposer cette approche.

À première vue, SWISS21 semble imbattable : pourquoi payer 25 CHF/mois quand on peut avoir un outil gratuit ? La réalité est plus nuancée.

💎 Qualité vs Gratuité

"Gratuit" ne signifie pas toujours "meilleur". ToBill investit dans l'expérience utilisateur, le support client et l'innovation (IA, automatisations) grâce à son modèle payant.

Avantages de ToBill :

  • Support client prioritaire (SWISS21 a un support limité)
  • Interface moderne sans publicité (SWISS21 affiche des offres tierces)
  • IA pour scanner les dépenses (absent chez SWISS21)
  • Focus produit et innovation continue (SWISS21 évolue peu)
  • Garantie de pérennité (modèle économique clair)

Avantages de SWISS21 :

  • Plan gratuit complet (idéal pour très petites structures)
  • Plans payants très abordables (7 CHF/utilisateur)
  • Suite de produits (POS, e-commerce, facturation)

🎯 Notre verdict : Choisissez SWISS21 si vous démarrez une micro-activité et avez un budget zéro. Choisissez ToBill si vous cherchez une expérience premium, un support réactif et des innovations continues.

Quel logiciel choisir selon votre profil ?

👤 Vous êtes freelance ou indépendant

Vous avez besoin d'une solution simple, rapide et abordable pour gérer vos devis et factures sans complexité inutile.

→ Recommandation : ToBill ou Magic Heidi

🏢 Vous êtes une PME (3-20 employés)

Vous cherchez un outil collaboratif avec gestion des utilisateurs et report automatique vers votre fiduciaire.

→ Recommandation : ToBill (rapport qualité-prix) ou Bexio (si besoin d'un ERP complet)

📊 Vous êtes fiduciaire

Vous avez besoin d'un accès centralisé aux documents comptables de vos clients avec report automatique.

→ Recommandation : ToBill (portail fiduciaire dédié) ou Bexio

💰 Budget très limité (0-10 CHF/mois)

Vous démarrez une micro-activité et cherchez une solution gratuite ou très abordable.

→ Recommandation : SWISS21 (gratuit) ou ToBill Starter (gratuit limité)

🚀 Vous cherchez le plus moderne

Interface design, IA intégrée, automatisations poussées, apps mobiles natives.

→ Recommandation : ToBill ou Magic Heidi

🏭 Grande entreprise (20+ employés)

Vous avez besoin d'un ERP complet avec gestion de projets, paie, CRM, stock, etc.

→ Recommandation : Bexio ou solution ERP sur mesure

Questions fréquentes

Quel est le meilleur logiciel de facturation suisse en 2025 ?

Il n'y a pas de "meilleur" logiciel universel. Tout dépend de vos besoins : • ToBill : Meilleur rapport qualité-prix pour freelances/PME • Bexio : Meilleur ERP tout-en-un pour grandes PME • Magic Heidi : Meilleures apps mobiles natives • SWISS21 : Meilleure solution gratuite

Combien coûte un logiciel de facturation en Suisse ?

Les prix varient de 0 à 45+ CHF/mois : • Gratuit : SWISS21 (plan complet), ToBill Starter (limité) • 7-25 CHF/mois : SWISS21 payant, ToBill Pro • 30 CHF/mois : Magic Heidi, MILKEE, Smallinvoice • 45+ CHF/mois/utilisateur : Bexio

ToBill est-il adapté aux fiduciaires suisses ?

Oui, ToBill propose un portail fiduciaire dédié qui permet aux fiduciaires de recevoir automatiquement les factures et dépenses de leurs clients. Cette fonctionnalité est incluse dans tous les plans (Pro et Entreprise).

Tous ces logiciels génèrent-ils des QR-factures conformes ?

Oui, tous les logiciels mentionnés dans ce comparatif génèrent des QR-factures conformes aux normes suisses. La QR-facture est devenue obligatoire en Suisse depuis octobre 2022, donc tous les acteurs du marché proposent cette fonctionnalité.

Puis-je essayer ToBill gratuitement ?

Oui, ToBill propose deux options : 1. Plan Starter gratuit : Limité à 5 clients et 5 factures, idéal pour tester l'interface 2. Essai gratuit de 10 jours : Accès complet au plan Pro sans carte bancaire requise

Quel logiciel supporte le mieux les multi-devises ?

Tous les logiciels mentionnés supportent les multi-devises (CHF, EUR, USD, etc.). ToBill se démarque en mettant à jour automatiquement les taux de change du jour, ce qui évite les saisies manuelles.

ToBill propose-t-il une application mobile ?

ToBill propose actuellement une application web responsive qui fonctionne sur tous les navigateurs (ordinateur, tablette, mobile). Les applications mobiles natives (iOS et Android) sont prévues pour 2025.

Comment migrer de Bexio/Magic Heidi vers ToBill ?

ToBill propose un import de données depuis les principaux concurrents (Bexio, Magic Heidi, etc.). Vous pouvez importer vos clients, articles et factures en quelques clics. Contactez le support ToBill pour une migration assistée.

ToBill est-il conforme aux normes suisses (TVA, QR-facture) ?

Oui, ToBill est 100% conforme aux normes suisses : • QR-facture : Génération automatique conforme • TVA suisse : Taux 8.1%, 2.6%, 3.8% préconfigurés • Multi-taxes : Par ligne ou total • Numérotation : Personnalisable et conforme aux exigences comptables

Quel support client proposent ces logiciels ?

• ToBill : Support prioritaire par email/chat, guides interactifs multilingues • Bexio : Support multilingue étendu, nombreux partenaires • Magic Heidi : Support par email, documentation en ligne • MILKEE : Support personnalisé par le fondateur • Smallinvoice/SWISS21 : Support standard par email

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Comparatif Logiciels de Facturation Suisse 2025 : ToBill vs Bexio vs Magic Heidi